Pepe ha definido a Mourinho, entrenador con el que ya no tiene relación después de tener sus más y sus menos en su etapa como entrenador del Real Madrid. «Zidane y Mourinho son lo más opuesto que he visto. Yo estoy encantado con Zidane, toda la plantilla está encantada. Él nos ha dado un voto de confianza a la plantilla al no fichar este verano», ha comentado. Sobre su relación con Mourinho, Pepe ha reconocido que lo pasó mal: «Yo fui fuerte, superé lo que tenía que superar en el momento que me tocó y gracias a Dios puede seguir en el Real Madrid y nunca más hablé con Mourinho». «¡Mourinho me quiso jubilar! Me puso un año más incluso cuando habló de mi edad», ha dicho entre risas el central blanco.